失忆青年觉醒超越古朗基的力量，以假面骑士亚极陀之姿对抗未知威胁。
年轻的潜水员津上翔一在一次事故后失去记忆，被美杉教授一家收留。他逐渐发现自己拥有超乎常人的力量，并能变身为神秘的战士——假面骑士亚极陀。与此同时，一种不同于过往古朗基族的未知生命体“Unknown”开始袭击拥有超能力（超古代人类亚极陀之力觉醒者）的人类。警方成立专门小组调查。翔一在对抗Unknown、保护他人的过程中，与刑警冰川诚结识并并肩作战。他也开始追寻自己变身能力的源头和失去的记忆，逐渐触及到一个关乎人类起源与未来的巨大秘密，以及他作为“燃烧形态”亚极陀的终极使命。
作为平成假面骑士系列承前启后的重要作品，世界观设定宏大深邃，充满哲学思辨。亚极陀的造型和战斗设计极具特色，单元剧与主线结合紧密，主角的成长与失忆谜团扣人心弦，是特摄史上的经典之作。